Die Feuerwehr Markt Kaufering wird vom Kommandanten und seinem Stellvertreter geführt. Die aktive Mannschaft ist in zwei sogenannte Einsatzzüge aufgeteilt. Diese werden von je einem Zugführer geleitet. Jedem Zugführer stehen 3 Gruppenführer für Ihre Arbeit zur Verfügung.
Weitere Sonderfunktionen sind der Leiter des Atemschutzes, der Ausbilder Maschinisten und ein Zugführer zur besonderen Verwendung.